微生物种群鉴定测序

微生物种群鉴定测序（16S/18S/ITS）技术解析

自然界中的微生物种类繁多、数量庞大，且绝大多数微生物无法通过传统实验室培养的方式进行观察和研究。目前已知的微生物种类已超十万种，这一数字仍在持续快速增长。

相较于传统的生化分型与表型分型方法，DNA 测序鉴定技术具备更高的准确性与便捷性，该技术不依赖菌种自身特性，可适用于所有菌种的鉴定分析。依托先进的测序仪器与多年积累的微生物检测实操经验，我们能够为客户提供高效、精准且权威的微生物检测服务，服务范围涵盖细菌 16S rDNA 测序、真菌 18S rDNA 测序及 ITS 测序三大核心类别。

16S rDNA 测序

作为环境微生物群落多样性研究的核心靶标基因测序技术，16S rDNA 测序通过对覆盖该基因的一个或多个连续可变区进行 PCR 扩增与测序，实现对样本中微生物群落组成成员的精准鉴定，以及多样本微生物群落结构的对比分析。

采用 Illumina HiSeq 2500 与 MiSeq 测序平台开展 16S rDNA 单区域测序，可实现更高的样本测序深度，有效鉴定出样本中的低丰度群落成员，同时具备成本优势，能够高效支撑各类科研项目开展。

18S rDNA 测序

18S rDNA 是编码真核生物核糖体小亚基 rRNA（18S rRNA）的 DNA 序列，其高变区序列能够直观体现物种间的遗传差异。通过对 18S rDNA 序列进行测序分析，可在较高分类级别上确定样本中真核微生物的物种归属。

ITS 测序

ITS（Internal Transcribed Spacer）即真菌核糖体基因内转录间隔区，是位于真菌核糖体 DNA（rDNA）上 18S 和 28S 基因之间的序列片段，主要包含内转录间隔区 1（ITS1）、5.8S rDNA 与内转录间隔区 2（ITS2）三部分，两侧分别连接 18S rRNA 基因与 28S rRNA 基因。

由于受到的选择压力较小，ITS 序列在自然界中进化变异速度较快，在绝大多数真菌中呈现出显著的序列多态性 ——种内序列相对保守一致，种间序列差异明显，这一特性使其非常适合真菌的物种鉴定及系统发育分析。

ITS 测序鉴定方法兼具快速、准确的优势，有效弥补了传统真菌鉴定方法的短板。通过 ITS 序列分析，能够精准反映出真菌属间、种间乃至菌株间的碱基对差异，且分析流程简便易行，目前已被广泛应用于真菌属内不同种间或近似属间的系统发育研究领域。

流程图

核心技术优势

配备MiSeq 专业测序平台，可在保障数据高质量的同时，实现高性价比交付，精准匹配客户项目需求。

沉淀丰富的同类项目实操经验，能够为项目的顺利开展与高效落地提供全方位支撑。

基因组层次研究服务注意事项

样本质量与规范管理需提供高纯度、高浓度的 DNA 样本，建议浓度≥50ng/μL，OD260/280 值稳定在 1.8–2.0，确保样本无降解、无外源污染；对于 FFPE 等特殊样本，需提前完成核酸完整性评估。样本需设置唯一标识，运输全程保持低温环境，并详细记录保存条件，杜绝样本混淆问题。

技术方案科学匹配需结合具体研究目的（如疾病关联分析、物种进化研究等）选定适配技术：全基因组测序可优先选用 Illumina 平台，结构变异检测则推荐 PacBio 等长读长测序技术。需与服务方充分沟通，明确测序深度、文库类型等核心参数，确保技术方案的灵敏度完全满足研究需求。

数据与结果严谨验证要求服务方提供完整的原始数据、质控报告及标准化分析流程，数据分析需基于人类基因组 GRCh38 等权威数据库进行序列比对与注释。针对关键变异位点，需通过 Sanger 测序等方法进行交叉验证，保障结果准确性。同时，需严格落实数据隐私保护措施，防范遗传信息泄露风险。