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lncRNA 测序技术简介
长链非编码 RNA（long noncoding RNA, lncRNA）是一类长度介于 200～100000nt 之间、不具备蛋白质编码功能的 RNA 分子。这类 RNA 存在带 polyA 尾与不带 polyA 尾两种结构形式，具有跨物种保守性低、组织特异性表达、整体丰度偏低等显著特征。
从基因组转录占比来看，lncRNA 的种类远超编码 RNA。据保守估算，哺乳动物基因组序列中，约 4%～9% 的区域可转录生成 lncRNA 转录本，而编码蛋白质的 RNA 对应的基因组占比仅为 1%～5%。
目前研究表明，lncRNA 的功能机制广泛且多样，主要参与转录调控、转录后调控、蛋白质运输及 mRNA 降解等关键生物学过程。凭借其多样的调控作用，lncRNA 已成为非编码 RNA 研究领域的核心热点。借助高通量测序技术，研究人员能够高效筛选出与疾病发生发展或特定生物学过程密切相关的 lncRNA 分子，进而开展深度机制研究。
流程图
lncRNA 测序
简介
长链非编码 RNA（long noncoding RNA, lncRNA）是一类长度介于 200~100000nt、不具备蛋白质编码功能的 RNA 分子。这类 RNA 存在带 polyA 尾与不带 polyA 尾两种结构形式，具有跨物种保守性低、组织特异性表达、丰度偏低等特征。
从数量上看，lncRNA 的种类远超编码 RNA。据保守估算，哺乳动物基因组序列中，有 4%~9% 的序列可转录生成 lncRNA 转录本，而对应的蛋白编码 RNA 转录本占比仅为 1%~5%。
目前研究表明，lncRNA 的功能机制主要涵盖参与转录调控、转录后调控、蛋白质运输及 mRNA 降解等多个层面。凭借其多样的调控作用，lncRNA 已成为非编码 RNA 研究领域的核心热点。借助高通量测序技术，研究人员能够高效筛选出与疾病或特定生物学过程相关的 lncRNA，进而开展深度机制研究。
技术优势
信息覆盖全面：采用去 rRNA 建库策略，单个文库即可同步完成 lncRNA 与 mRNA 的联合分析，有效降低实验成本。
检测准确度高：依托链特异性建库方法，可大幅提升反义 lncRNA 的鉴定精度。
研究前瞻性强：具备海量未知 lncRNA 的发掘能力，适用于各类物种的 lncRNA 研究。
转录信息完整：可获取 lncRNA 的全长度转录信息，为功能解析提供全面数据支撑。
smallRNA 测序
简介
smallRNA 是参与生命活动调控的核心分子，在基因表达调控、生物个体发育、物质代谢及疾病发生发展等诸多生理过程中发挥关键作用。其主要类型包括 miRNA、piRNA 和 siRNA，晶能生物可提供全类型 smallRNA 测序服务。
miRNA：是一类长度为 21～25nt 的单链小分子 RNA，广泛存在于真核生物体内。成熟 miRNA 由具有发夹结构的单链 RNA 前体（pre-miRNA）经 Dicer 酶剪切加工而成，主要通过与靶标基因不完全互补结合的方式调控靶基因表达。目前，miRNA 在细胞发育、生物标志物筛选、肿瘤诊疗等领域已得到广泛应用。
piRNA：是一类长度为 26～31nt 的单链小 RNA，其长度大多集中在 29～30nt 区间。这类 RNA 的表达具有严格的组织特异性，仅存在于生殖细胞、肿瘤细胞、干细胞等具有全能性的动物细胞中。piRNA 需与 Piwi 亚家族蛋白结合形成 piRNA 复合物（piRC），才能发挥生物学功能，具体包括沉默转录基因、维持生殖系与干细胞功能、调节翻译过程及 mRNA 稳定性等。此外，piRNA 在部分癌细胞中存在异常表达现象，这提示其可能参与癌症发生进程，有望成为癌症诊断与治疗的潜在生物标志物。
siRNA：即内源性干扰小 RNA，主要包括 ta-siRNA、ra-siRNA 和 nat-siRNA 三个亚型。其中，ta-siRNA（天然反义转录小干扰 RNA）由 TAS 基因编码，经 miRNA 剪切产生，长度为 21nt，作用机制与 miRNA 类似；ra-siRNA 来源于重复序列、转座子及异染色质区域，长度多为 24nt；nat-siRNA 则由天然反义转录本（序列与同区域互补链上基因的 mRNA 方向相反且部分重叠）产生。siRNA 的功能主要与植物逆境胁迫响应及生物发育调控密切相关。
流程图
技术优势
检测完整性优异：单次实验即可实现多种 smallRNA 的同步检测，数据信息与数据库实时同步，保障结果全面性。
数据可靠性突出：依托高数据量支撑，可对不同丰度的 smallRNA 进行精准定量，确保实验数据的准确性与稳定性。
研究前瞻性显著：具备未知 smallRNA 的发掘能力，突破物种限制，适用于各类物种的 smallRNA 研究工作。
环状 RNA 测序
简介
环状 RNA 测序是转录组测序领域的一项新兴技术。在过往研究中，科研界普遍认为细胞内的非编码 RNA 大多以线性结构存在；而近年来，越来越多的研究证实，环状 RNA 在哺乳动物细胞中的实际表达量，远超以往的认知水平。
作为长链非编码 RNA 研究的新热点，环状 RNA 可通过多种途径参与基因表达调控，例如吸附 miRNA 以阻断其作用、调控宿主基因的表达等，为基因调控机制的深入探索提供了全新方向。
流程图
技术优势
科学性突出：已成功研发可靠的环状 RNA 建库方法与配套分析流程，为实验开展提供标准化技术支撑。
可靠性优异：依托高数据量测序，可对不同丰度的环状 RNA 实现精准鉴定与定量分析，保障数据准确性。
前瞻性显著：具备大规模新环状 RNA 的发掘能力，适用范围广泛，可满足多类物种的研究需求。
lncRNA 测序注意事项
样本处理样本采集后需立即置于 - 80℃低温环境保存，严格避免反复冻融，防止 RNA 发生降解。提取环节应选用可富集长链 RNA 的专用试剂盒，确保 RNA 完整性达到RIN 值≥7的标准；同时需去除 rRNA，以此提升 lncRNA 的检测效率，避免其对测序结果造成干扰。
测序策略推荐采用转录组测序技术，优先选择 PE150 及以上的配对末端测序模式，保障序列拼接的准确性。测序深度需结合研究需求合理设定，一般建议不低于 30M reads，确保低表达 lncRNA 也能被有效覆盖；实验设计需设置至少 3 次生物学重复，最大程度降低实验误差。
数据分析借助 LNCipedia、NONCODE 等专业数据库进行序列比对与功能注释，采用 Cufflinks 等工具开展差异表达分析。鉴于 lncRNA 结构复杂的特性，分析过程中需注重区分真实转录本与背景噪音；关键结果需结合 qRT-PCR 等实验手段进行验证，避免出现数据解读偏差。
